گسترش مفهوم وب ۳ در این روزها نگرانیهای بسیاری در خصوص امنیت اینگونه تکنولوژیها به همراه داشته است. بسیاری از کارشناسان ادعا میکنند که موضوع امنیت هنوز به طور جدی در ساختار وب ۳ مطرح نشده است. همچنین آنان یکی از مهمترین مشکلات تکنولوژیها مبتنی بر وب ۳ را کند بودن سرعت تراکنشها در آن میدانند. یکی دیگر از مشکلات پیش رو وب ۳ بالا بودن هزینه تراکنش در اینگونه بسترها است. موضوع مهم بعدی چالش برقراری عدم تمرکز واقعی در وب ۳ است که به باور بسیاری از افرد هنور برآورده نشده است. چیزی که پیداست این است که وب ۳ برای رسیدن به جایگاه واقعی خود راه زیادی در پیش دارد.